میان این دو کلمه در مفهومشان اشتباهی وجود دارد و بدین وسیله بسیاری از مردم فکر می کنند که هر دو یکسانند.
فطرت یعنی قانون آفرینش می باشد و هر چیزی که در نتیجه این قانون تشکیل شده است. ولی سنت الله قوانین و دستورات است که خدای تعالی آنها را به جوامع به وسیله پیامبران خود ارسال کرده است و این قوانین هرگز قابل تغییر نیست. راجع این مطلب این دو آیه را می توان مطرح کرد:
سُنَّةَ مَنْ قَدْ أَرْسَلْنَا قَبْلَكَ مِنْ رُسُلِنَا ۖ وَلَا تَجِدُ لِسُنَّتِنَا تَحْوِيلًا
(این است ) سنّت و طریقه فرستادگانمان که پیش از تو فرستادیم و هرگز در سنّت جاریه ما تغییری نمی یابی. (اسراء 77)
سُنَّةَ اللَّهِ الَّتِي قَدْ خَلَتْ مِنْ قَبْلُ ۖ وَلَنْ تَجِدَ لِسُنَّةِ اللَّهِ تَبْدِيلًا
سنّت الهی بر این بوده و ابدا در سنّت خدا تغییری نخواهی یافت.